Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LETM2Q2VYF4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LETM2Q2VYF4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LETM2Q2VYF4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LETM2Q2VYF4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LETM2Q2VYF4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LETM2Q2VYF4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LETM2Q2VYF4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LETM2Q2VYF4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LETM2Q2VYF4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LETM2Q2VYF4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LETM2Q2VYF4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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