Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM1Q2NKQ1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms