Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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