Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTC4SQ16873 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTC4SQ16873 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms