Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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