Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DDB1Q16531 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
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