Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX1Q16384 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX1Q16384 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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