Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC85BQ15834 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC85BQ15834 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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