Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX1-1Q15270 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX1-1Q15270 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms