Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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