Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF1Q14162 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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