Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCINQ13939 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCINQ13939 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCINQ13939 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCINQ13939 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCINQ13939 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCINQ13939 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCINQ13939 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCINQ13939 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCINQ13939 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCINQ13939 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCINQ13939 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCINQ13939 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCINQ13939 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCINQ13939 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCINQ13939 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CCINQ13939 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CCINQ13939 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCINQ13939 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCINQ13939 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCINQ13939 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCINQ13939 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCINQ13939 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCINQ13939 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCINQ13939 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCINQ13939 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCINQ13939 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCINQ13939 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCINQ13939 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCINQ13939 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCINQ13939 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCINQ13939 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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