Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCGQ13326 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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