Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
STRN3Q13033 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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