Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNDQ07001 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNDQ07001 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNDQ07001 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNDQ07001 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNDQ07001 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNDQ07001 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNDQ07001 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNDQ07001 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNDQ07001 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNDQ07001 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNDQ07001 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNDQ07001 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNDQ07001 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms