Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FMODQ06828 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FMODQ06828 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FMODQ06828 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FMODQ06828 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FMODQ06828 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FMODQ06828 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FMODQ06828 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FMODQ06828 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FMODQ06828 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FMODQ06828 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FMODQ06828 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FMODQ06828 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms