Protein–RNA interactions for Protein: Q02985

CFHR3, Complement factor H-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR3Q02985 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR3Q02985 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR3Q02985 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms