Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNB1Q02641 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB1Q02641 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms