Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F1Q01094 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms