Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RND3P61587 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RND3P61587 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RND3P61587 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RND3P61587 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RND3P61587 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RND3P61587 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RND3P61587 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RND3P61587 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RND3P61587 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND3P61587 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RND3P61587 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RND3P61587 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND3P61587 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms