Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVPABLB-1P60509 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms