Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX10P56693 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX10P56693 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX10P56693 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX10P56693 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX10P56693 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX10P56693 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX10P56693 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX10P56693 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX10P56693 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX10P56693 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX10P56693 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX10P56693 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX10P56693 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX10P56693 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX10P56693 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX10P56693 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX10P56693 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX10P56693 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX10P56693 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX10P56693 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX10P56693 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX10P56693 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX10P56693 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX10P56693 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX10P56693 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX10P56693 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX10P56693 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX10P56693 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX10P56693 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX10P56693 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX10P56693 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX10P56693 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms