Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms