Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSWP56202 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSWP56202 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSWP56202 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSWP56202 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSWP56202 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSWP56202 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSWP56202 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSWP56202 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSWP56202 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSWP56202 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSWP56202 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSWP56202 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSWP56202 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSWP56202 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSWP56202 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSWP56202 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSWP56202 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSWP56202 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSWP56202 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSWP56202 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSWP56202 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSWP56202 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSWP56202 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSWP56202 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSWP56202 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSWP56202 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSWP56202 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSWP56202 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSWP56202 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSWP56202 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSWP56202 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSWP56202 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSWP56202 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSWP56202 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSWP56202 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSWP56202 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSWP56202 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSWP56202 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms