Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP9P55211 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP9P55211 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CASP9P55211 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CASP9P55211 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CASP9P55211 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CASP9P55211 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms