Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP7P55210 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP7P55210 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP7P55210 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP7P55210 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms