Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACLYP53396 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACLYP53396 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACLYP53396 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACLYP53396 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACLYP53396 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACLYP53396 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACLYP53396 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACLYP53396 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACLYP53396 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACLYP53396 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACLYP53396 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACLYP53396 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACLYP53396 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACLYP53396 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACLYP53396 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACLYP53396 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACLYP53396 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACLYP53396 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACLYP53396 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACLYP53396 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACLYP53396 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACLYP53396 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ACLYP53396 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACLYP53396 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACLYP53396 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACLYP53396 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACLYP53396 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACLYP53396 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACLYP53396 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACLYP53396 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACLYP53396 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACLYP53396 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACLYP53396 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms