Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCNN1GP51170 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCNN1GP51170 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCNN1GP51170 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCNN1GP51170 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCNN1GP51170 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCNN1GP51170 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCNN1GP51170 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCNN1GP51170 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCNN1GP51170 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCNN1GP51170 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCNN1GP51170 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCNN1GP51170 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCNN1GP51170 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCNN1GP51170 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCNN1GP51170 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCNN1GP51170 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCNN1GP51170 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCNN1GP51170 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCNN1GP51170 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCNN1GP51170 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCNN1GP51170 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCNN1GP51170 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCNN1GP51170 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCNN1GP51170 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCNN1GP51170 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms