Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GSK3BP49841 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms