Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRIM1P49642 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms