Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK8P49336 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK8P49336 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK8P49336 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK8P49336 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK8P49336 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK8P49336 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK8P49336 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms