Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRPC1P48995 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRPC1P48995 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms