Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIP4K2AP48426 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIP4K2AP48426 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms