Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA4P48058 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms