Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTRNP46939 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTRNP46939 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTRNP46939 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTRNP46939 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTRNP46939 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTRNP46939 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTRNP46939 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTRNP46939 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UTRNP46939 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UTRNP46939 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
UTRNP46939 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UTRNP46939 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
UTRNP46939 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTRNP46939 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTRNP46939 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTRNP46939 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UTRNP46939 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UTRNP46939 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTRNP46939 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTRNP46939 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTRNP46939 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTRNP46939 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTRNP46939 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTRNP46939 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTRNP46939 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTRNP46939 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UTRNP46939 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UTRNP46939 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UTRNP46939 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTRNP46939 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTRNP46939 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTRNP46939 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTRNP46939 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTRNP46939 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTRNP46939 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTRNP46939 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTRNP46939 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTRNP46939 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTRNP46939 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTRNP46939 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UTRNP46939 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UTRNP46939 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms