Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRXP46100 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRXP46100 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRXP46100 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATRXP46100 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATRXP46100 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ATRXP46100 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATRXP46100 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRXP46100 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms