Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK1P39086 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms