Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms