Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN7P35236 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms