Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNB1P35222 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms