Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP1P32455 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP1P32455 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBP1P32455 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBP1P32455 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBP1P32455 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms