Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHA2P29317 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms