Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSFA2P28290 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms