Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms