Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTPRGP23470 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRGP23470 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRGP23470 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
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