Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms