Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXB9P17482 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms