Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM27P14373 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM27P14373 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms