Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKBP12277 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKBP12277 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKBP12277 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKBP12277 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CKBP12277 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKBP12277 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKBP12277 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CKBP12277 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKBP12277 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CKBP12277 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CKBP12277 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CKBP12277 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CKBP12277 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CKBP12277 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CKBP12277 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CKBP12277 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKBP12277 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKBP12277 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms