Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRPRAP08240 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRPRAP08240 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms